Кирилл Серебренников родился 7 сентября 1969 года в Ростове-на-Дону. Поставил свой первый спектакль еще будучи школьником. В 1992 году с красным дипломом окончил физический факультет Ростовского государственного университета. Занимался режиссурой еще в студенческие годы: сначала в любительской студии «69», с 1990 года — на профессиональной сцене.
За семь лет поставил десять спектаклей во всех театрах Ростова-на-Дону: театре «Ангажемент», Академическом театре драмы имени М. Горького, Академическом театре юного зрителя. Постановки неоднократно признавались лучшими спектаклями сезонов и получали призы на Всероссийских Фестивалях.
С 1991 года также стал активно работать на телевидении: сначала в телекомпании «Южный регион», потом в ГТРК «Дон-ТР». За те же семь лет снял 11 видеоклипов, 2 документальных фильма, 4 телеспектакля, 1 видеоартовскую картину, 1 музыкальный телефильм, 3 многосерийных проекта: два — о музыке, третий — о кино, около 100 рекламных роликов. С 1998 года стал заниматься кинематографом. Среди его работ — 6 художественных фильмов, 1 документальный и 4 сериала.
В 2008 году набрал экспериментальный актерско-режиссерский курс в Школе-студии МХАТ. Из этого курса к выпускному 2012 году была сформирована «Седьмая студия», позже ставшая одним из резидентов «Гоголь-центра». В 2011—2014 годах был художественным руководителем проекта «Платформа» в Центре современного искусства «Винзавод».
В августе 2012 года Кирилл Серебренников был назначен департаментом культуры г. Москвы новым художественным руководителем Московского драматического театра имени Н. В. Гоголя.
Ко дню рождения режиссера была приурочена премьера документального фильма «После Лета». Режиссер смонтировал его за год, который находился под арестом.
Основная фактура «После Лета» — это документальные вставки, которые не вошли в «основной» фильм, серия интервью с близкими Майка Науменко и другими ключевыми фигурами советской рок-музыки. В фильме о русском роке, 1980-х, советской молодежи, ленинградском быте и духе того времени рассказывают Наталья Науменко, Артемий Троицкий, Игорь Петровский, Сева Новгородцев и Андрей Тропилло. Все это происходит в декорациях фильма «Лето» Серебренникова о Цое.